مسجد جامع خمین با معماری متعلق به دوره قاجاریه و مساحتی ۳ هزار مترمربعی در انتهای بازار خمین یکی از آثار تاریخی این شهره که به ثبت ملی رسیده. این مسجد در معماری از دو سبک قدیم و جدید بهره برده، معماری قدیمی مسجد در سمت غرب و معماری جدید در سمت شرقشه. بافت معماری قسمت قدیمی مسجد بیش از یک متر، درعمق زمین احداث شده. کل سقف‌هاش توسط آجرهای پخته به رنگ قرمز ونخودی در قالب طاق بر روی ستون‌های قطور آجری ساخته شده. بافت کالبدی این مسجد طوری طراحی شده که در زمستان هوای داخلش گرم و در تابستان خنکه. دیگر ویژگی این مسجد شبستانشه که ۲۲ ستون در کناره‌ها و ۱۸ ستون در وسط مسجد و طاق ضربی شکل در هفت ردیف قرار داره و مساحتش ۴۰۰ متر مربعه.
برای ورود به این مسجد باید چند پله رو به سمت پایین طی کرد و بعد وارد محوطه داخلی مسجد شد. این اثر در تاریخ ۹ فروردین ۱۳۷۸ با شمارهٔ ثبت ۲۲۹۵ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده.